基于大型队列鉴定肺腺癌共刺激 / 共抑制分子亚型并预测肿瘤预后和免疫特征

摘要

目的 : 共刺激 / 共抑制分子通过 T 细胞信号转导影响抗肿瘤免疫反应。本研究通过分子亚型鉴定，探究了共刺激
/ 共抑制分子对肺腺癌预后和免疫微环境的预测性能。方法 : 本研究纳入了 1456 例肺腺癌样本和 76 例对照样本，从中进一
步提取 74 个共刺激 / 共抑制分子的表达数据并筛选在肿瘤和对照样本中具有显著差异的基因。基于 ConsensusClusterPlus，
研究对样本进行了共刺激 / 共抑制亚型分析，比较了不同亚型间的生存预后、临床表型、突变状态、免疫评分和免疫细胞
浸润的差异。最后，研究纳入了独立的 UCSC 肺腺癌数据集，用于分子亚型的外部验证。结果 : 本研究共筛选了 16 个在肺
腺癌和对照样本中显著差异表达的共刺激 / 共抑制分子，并鉴定出三个疾病分子亚型，其中 cluster1 预后最好，而 cluster3
预后最差。同时，这些共刺激 / 共抑制分子绝大部分在 cluster3 中显著低表达。通过亚型间的临床和突变特征比较，我们发
现性别、总生存状态、KRAS 突变状态和 STK11 突变状态可能是 cluster1 和 3 预后差异的原因。此外，我们还发现 cluster3
的免疫评分和基质评分显著降低，而多种免疫细胞浸润异常升高，提示 cluster3 中可能存在抗肿瘤免疫抑制导致预后不良。
结论 : 本研究筛选的 16 个共刺激 / 共抑制分子可作为肺腺癌分子亚型的标志物，预测肺腺癌的生存预后和免疫特征。