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辐射前后甲状腺癌细胞 circRNA 的表达谱差异分析

张 杰, 李 沥珂, 吴 振宇, 贾 恒哲, 田 延锋

摘要

目的:通过探讨辐射暴露前后甲状腺细胞系及甲状腺癌组织中 circRNA 表达谱的变化,旨在揭示 circRNA 在甲
状腺癌发生发展中可能的作用机制。方法:本研究对辐射前后甲状腺癌细胞(TPC-1、BCPAP)及甲状腺滤泡上皮细胞
(Nthy-ori-3-1)进行高通量测序,并与临床甲状腺癌样本对比。使用医用电子直线加速器提供 4 Gy 辐射处理样本,采用
Trizol 法提取总 RNA,经 Illumina 平台测序,并用 Bowtie2、TopHat2 进行数据比对和注释。筛选出的差异表达 circRNA
通过 miRNA 结合预测,并进行 GO 和 KEGG 富集分析,识别潜在靶基因及相关信号通路。结果:辐射处理后,甲状腺癌
细胞和滤泡上皮细胞中大量 circRNA 差异表达。BCPAP 和 TPC-1 细胞株的差异 circRNA 分别为 9504 和 9751 个,临床样
本中则较少。大部分 circRNA(90.81%)来源于编码区域,少部分来自基因间区域,其中 1 号和 2 号染色体上的数量最多,
21 号最少。主要富集于 Wnt 和 PI3K-Akt 信号通路。结论:辐射影响下的 circRNA 可作为关键调控枢纽,通过 miRNA 的
海绵机制调控关键生物过程和信号通路,为甲状腺癌分子机制研究及新治疗靶点开发奠定基础。

关键词

辐射;环状 RNA;甲状腺癌;高通量测序

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