基于生物信息学筛选卵巢透明细胞癌发生的关键基因和治疗靶点分析

摘要

目的 基于生物信息分析卵巢透明细胞癌（OCCC）的关键基因，进而找到有效的诊断靶标和治疗方法。方法 通
过 GEO 数据库、limma 差异分析差异基因、WGCNA 等生物信息学方法发现 hub 基因，通过蛋白质互相作用网络建议和
Friends 分析方法发现潜在的关键基因。 结果 通过 GEO 数据库生物信息学分析，发现 669 个基因出现差异性表达，可能
与 0CCC 发生发展密切相关的 313 个基因表达上调，356 个基因表达下调。通过 WGCNA 分析获得了 17 个共表达模块 ,
通过与差异基因基因合并，获取 302 个 hub 基因。对 302 个 hub gene 进行 PPI 网络分析，并通过 cytohubba 获取 10 个关键
基因，分别是 SERPINE1，MET，FGF7，VCAM1，MMP2，CXCL12，JUN，KIT，SNAI2，PDGFRB。通过 Friends 分析
PDGFRB 为 OCCC 的关键基因。STAT1，STAT3 和 ETS1 三个 TF 可以对关键基因 PDGFRB 起调控作用。结论 PDGFRB
是 OCCC 发生的核心基因，是治疗 OCCC 的潜在靶点。